NVIDIA Home > Список продуктов > Высокопроизводительные вычислительные решения > UGENE на графических процессорах Tesla
 |
Подписаться |  |
Делиться ссылкой |
UGENE на графических процессорах Tesla
UGENE от Unipro – это бесплатный кросс-платформенный программный пакет для работы в области биоинформатики, который объединяет множество популярных биологических инструментов в рамках одного гибкого пользовательского интерфейса. Для того чтобы обеспечить максимально возможную производительность, UGENE использует современные графические процессоры NVIDIA Tesla для оптимизации вычислительных процедур. UGENE включает реализацию алгоритма Смита-Уотермана с CUDA-ускорением и чрезвычайно быстрый алгоритм выравнивания коротких последовательностей ДНК с оптимизацией для CUDA GPU.
Загрузка и установка
- Скачайте Unipro UGENE
- Нет необходимости в установке дополнительного ПО при работе под управлением операционных систем MS Windows, Linux и Mac OS X
- Включает реализацию алгоритма Смита-Уотермана с CUDA-ускорением и чрезвычайно быстрый алгоритм выравнивания коротких последовательностей ДНК
- Руководство пользователя для UGENE (установка и документация)
Данные бенчмарков
Реализация алгоритма Смита-Уотермана с CUDA-ускорением обеспечивает прирост производительности до 9 раз по сравнению с параллельной реализацией алгоритма (также поставляемой в пакете UGENE) и 40-кратное ускорение по сравнению с классической реализацией. Более подробная информация доступна на странице теста производительности UGENE .
 |
 |
Технические доклады и презентации
- Техотчет:“Применение универсальных вычислений на GPU для ускорения выравнивания коротких последовательностей ДНК в Unipro UGENE”
- Прочие публикации на тему ускорения приложений в области био-информатики при помощи графических процессоров
Форумы
Интервью / Видео
- Подкаст UGENE : Выполнение локального выравнивания последовательности при помощи алгоритмома Смит-Уотермана
GPU РЕШЕНИЯ
Приложения Tesla Bio Workbench могут быть установлены на настольных персональных суперкомпьютерах на основе GPU или в центрах обработки данных. Построенные на революционной массивно-параллельной архитектуре CUDA решения направлены на ускорение развития вычислительной науки.
РЕКОМЕНДОВАННАЯ АППАРАТНАЯ КОНФИГУРАЦИЯ
| Настольные ПК | Центры обработки данных |
|
|