NVIDIA Home > Список продуктов > Высокопроизводительные вычислительные решения > GPU-HMMER на Tesla GPU
 |
Подписаться |  |
Делиться ссылкой |
GPU-HMMER на Tesla GPU
GPU-HMMER - это ПО для работы в области био-информатики, применяемое для выравнивания последовательностей белка при помощи профиля HMM благодаря преимуществам массивно параллельной архитектуры CUDA в графических процессорах NVIDIA Tesla. GPU-HMMER превосходит HMMER (2.0) в скорости работы в 60-100 раз.
Закачка и установка
Данные бенчмарк тестов
GPU-HMMER обеспечивает ускорение работы инструмента hmmsearch при помощи GPU и достигает прироста скорости в 60-100 раз. GPU-HMMER может работать с несколькими Tesla GPU в рабочей станции, позволяя сокращать время поиска с часов на CPU до минут на GPU.
 |
Технические документы
- "Исследование использования GPU в сегментации изображения печени и поиске в базе данных HMMER, Д. П. Уолтерс (J. P. Walters), В. Балу (V. Balu), С. Компалли (S. Kompalli) и В. Чаудхари (V. Chaudhary): Международный симпозиум по параллельным и распределенным вычислениям (IPDPS), 2009
- Другие публикации, посвященные ускорению приложений в области био-информатикипри помощи GPU
Форумы и обсуждения
Решения на основе GPU
Представлены в качестве настольных персональных решений для супервычислений, способных превзойти 32-нодовый CPU кластер, или кластерного решения, обеспечивающего производительность традиционного суперкомпьютера для ресурсоемких задач при стоимости в 1/10 и потреблении электричества в 1/20. Построенные на основе революционной архитектуры CUDA решения созданы для ускорения научных вычислений.
РЕКОМЕНДУЕМАЯ КОНФИГУРАЦИЯ АППАРАТНОГО ОБЕСПЕЧЕНИЯ
| Конфигурация настольной рабочей станции | Конфигурация центра обработки данных |
|
|
 |
 |
|||||
|
РЕШЕНИЯ ДЛЯ РАБОЧИХ СТАНЦИЙ ПЕРСОНАЛЬНЫЙ СУПЕРКОМПЬЮТЕР TESLA Для персональных супервычислений за вашим рабочим столом
|
РЕШЕНИЯ ДЛЯ ЦЕНТРОВ ОБРАБОТКИ ДАННЫХ ВЫЧИСЛИТЕЛЬНЫЕ КЛАСТЕРЫ НА TESLA GPU Для вычислений на массивных установках
|